Je vous ai déjà parlé du not provided que l'on trouve dans GA en mots clés.
Une des méthodes que j'utilise et de considérer que la répartition des requêtes de recherche chez les possesseur d'un compte Google est la même que chez les autres et de réincorporer ces requêtes fantomes au prorata.
Si la requête toto représente 2% de (requêtes totale - les not provided), je considère quelle compte également 2% des not provided. En dehors du postulat qui peux être faux, tout cela est un peu chronophage et compliqué.
Quand Google a permis de lier les valeurs de requêtes des Google Webmaster Tools avec Analytics j'ai pensé avoir une autre piste, mais là je déchante un peu. D'abord parce que là on ne retrouve que les visites de Google.
Au final, j'en suis réduit à bricoler simplement parce que le dieu Google a décidé d'un truc tout seul sur son nuage.